Το όνομα κ. Παγούνη, όπως τονίζει σε συλλυπητήριο μήνυμά του ο νυν δήμαρχος, Λάζαρος Μαλούτας, «συνδέθηκε θετικά με τις μεγάλες προοδευτικές αλλαγές που έγιναν στην Αυτοδιοίκηση και που άφησαν ισχυρό το αποτύπωμά τους στην Κοζάνη».
Ο Γιάννης Παγούνης διετέλεσε δήμαρχος Κοζάνης την περίοδο από το 1983 έως το 1990. Επί θητείας του δημιουργήθηκε η πρώτη αναπτυξιακή μελετητική εταιρεία ΑΝΚΟ στην Ελλάδα με μετόχους δήμους της περιοχής της Κοζάνης, ενώ ήταν αυτός που οραματίστηκε και έβαλε τις βάσεις, με την εκπόνηση των πρώτων μελετών, για τη δημιουργία της Τηλεθέρμανσης Κοζάνης.
Αυτοδημιούργητος επιχειρηματίας, έδινε το «παρών» στον κοινωνικό και πολιτικό δημόσιο βίο της περιοχής μέχρι τον θάνατό του. Ήταν φιλότεχνος και φιλόμουσος, παρακολουθώντας πληθώρα εκδηλώσεων που ήταν αφιερωμένες στον Πολιτισμό ή τα Γράμματα.